Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRBP28702 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RXRBP28702 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RXRBP28702 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms