Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSFA2P28290 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms