Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SYT1P21579 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SYT1P21579 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms