Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRHP20396 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
TRHP20396 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRHP20396 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRHP20396 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRHP20396 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRHP20396 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms