Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms