Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF1P18846 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF1P18846 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF1P18846 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms