Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FLT1P17948 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLT1P17948 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FLT1P17948 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FLT1P17948 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms