Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms