Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.2 ms