Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI3P10071 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI3P10071 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI3P10071 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI3P10071 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI3P10071 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI3P10071 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI3P10071 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI3P10071 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI3P10071 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI3P10071 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI3P10071 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI3P10071 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms