Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX58O95786 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX58O95786 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms