Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms