Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSPNO60542 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSPNO60542 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSPNO60542 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSPNO60542 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSPNO60542 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSPNO60542 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSPNO60542 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSPNO60542 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSPNO60542 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSPNO60542 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms