Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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