Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MEFVO15553 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MEFVO15553 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MEFVO15553 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MEFVO15553 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MEFVO15553 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms