Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBDO15205 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBDO15205 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBDO15205 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
UBDO15205 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBDO15205 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBDO15205 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms