Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms