Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3C2AO00443 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms