Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms