Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN34H7C241 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN34H7C241 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms