Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms