Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms