Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms