Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLF12Q9Y4X4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms