Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms