Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC180Q9P1Z9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms