Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms