Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms