Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS1Q9NYS0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms