Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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