Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms