Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms