Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms