Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPAG4Q9NPE6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms