Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms