Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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