Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms