Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CPPED1Q9BRF8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CPPED1Q9BRF8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CPPED1Q9BRF8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CPPED1Q9BRF8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CPPED1Q9BRF8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CPPED1Q9BRF8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms