Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USB1Q9BQ65 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms