Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OPALINQ96PE5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms