Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf36Q96KX1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms