Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms