Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms