Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms