Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SFT2D1Q8WV19 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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SFT2D1Q8WV19 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SFT2D1Q8WV19 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SFT2D1Q8WV19 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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SFT2D1Q8WV19 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D1Q8WV19 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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