Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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