Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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