Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms