Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms