Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms